Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN3Q9UPQ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms