Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF18Q9UNG2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms