Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms