Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms