Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF112Q9ULX5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms