Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND8Q9ULU4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND8Q9ULU4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZMYND8Q9ULU4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms