Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB3Q9ULL4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms