Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIMKLBQ9ULI2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms