Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN2Q9ULH4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN2Q9ULH4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms