Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA11Q9UKX5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms