Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms