Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPN3Q9UHW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 688.8 ms