Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI5

SLC7A8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A8Q9UHI5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC7A8Q9UHI5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC7A8Q9UHI5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC7A8Q9UHI5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC7A8Q9UHI5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC7A8Q9UHI5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC7A8Q9UHI5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC7A8Q9UHI5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC7A8Q9UHI5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC7A8Q9UHI5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC7A8Q9UHI5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms