Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF20Q9UGU0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TCF20Q9UGU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms