Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms