Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DBF4Q9UBU7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DBF4Q9UBU7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms