Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms