Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EXTL2Q9UBQ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms