Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms