Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHPF2Q9P2E5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms