Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC45.99■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC45.97■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.94■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC45.94■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
CCDC180Q9P1Z9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
CCDC180Q9P1Z9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms