Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms