Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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