Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RDH8Q9NYR8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms