Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms