Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCM9Q9NXL9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms