Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CWC25Q9NXE8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms