Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX55

HYPK, Huntingtin-interacting protein K, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HYPKQ9NX55 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HYPKQ9NX55 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HYPKQ9NX55 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms