Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf42Q9NWW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms