Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PDS5BQ9NTI5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PDS5BQ9NTI5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms