Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT82Q9NSB4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT82Q9NSB4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms