Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms