Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXA1Q9NS26 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXA1Q9NS26 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms