Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGAP35Q9NRY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGAP35Q9NRY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms