Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.643e-10■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.83e-10■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.843e-10■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 BRD2-215ENST00000580234 718 ntTSL 428.41■■■□□ 2.144e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 220.32■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-216ENST00000560232 1195 ntTSL 218.12■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-213ENST00000557909 588 ntTSL 416.88■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-211ENST00000492850 615 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-214ENST00000559038 557 ntTSL 414.19□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-207ENST00000442313 496 ntTSL 312.75□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-201ENST00000271411 13945 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-203ENST00000367865 14332 ntTSL 26.58□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.813e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-211ENST00000567987 1926 ntTSL 1 (best)28.43■■■□□ 2.143e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-205ENST00000562441 1412 ntTSL 227.76■■■□□ 2.033e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 EHD1-207ENST00000457202 534 ntTSL 427.74■■■□□ 2.033e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.023e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.953e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.693e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-208ENST00000567065 883 ntTSL 323.39■■□□□ 1.333e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-203ENST00000540562 3064 ntTSL 219.54■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-213ENST00000569957 4469 ntTSL 216.85■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 INO80E-204ENST00000562291 255 ntTSL 314.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 211.79□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 USMG5-202ENST00000337003 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 USMG5-204ENST00000369815 626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 222.25■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 KCTD9-207ENST00000521458 541 ntTSL 229■■■□□ 2.232e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 KCTD9-204ENST00000518997 679 ntTSL 328.23■■■□□ 2.112e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 KCTD9-208ENST00000522493 530 ntTSL 428.23■■■□□ 2.112e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 KCTD9-203ENST00000518067 849 ntTSL 528.08■■■□□ 2.092e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 KCTD9-205ENST00000519665 2128 ntTSL 526.78■■□□□ 1.882e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 KCTD9-209ENST00000523140 840 ntTSL 326.27■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 KCTD9-211ENST00000524217 400 ntTSL 223.09■■□□□ 1.292e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 27.6
DROSHAQ9NRR4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.872e-7■■■■■ 27.5
DROSHAQ9NRR4 SMCO4-203ENST00000526869 374 ntTSL 1 (best)31.15■■■□□ 2.582e-7■■■■■ 27.5
DROSHAQ9NRR4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.797e-8■■■■■ 27.5
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.929e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.729e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.69e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.119e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.979e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-219ENST00000630986 588 ntTSL 215.99■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-215ENST00000629314 417 ntTSL 55.27□□□□□ -1.579e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 ITGA9-AS1-216ENST00000630010 575 ntTSL 55.27□□□□□ -1.579e-7■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 GIPR-204ENST00000588816 709 ntTSL 524.62■■□□□ 1.538e-9■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.456e-8■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 QSER1-203ENST00000527250 448 ntTSL 31.03□□□□□ -2.246e-8■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.171e-14■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 TICRR-203ENST00000561095 2367 ntTSL 1 (best)19.9■□□□□ 0.784e-10■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 319.09■□□□□ 0.654e-10■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.374e-10■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.826e-9■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.796e-9■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-201ENST00000307364 2586 ntTSL 1 (best)18.99■□□□□ 0.636e-9■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.536e-9■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.536e-9■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.516e-9■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM14C-202ENST00000466421 472 ntTSL 223.95■■□□□ 1.421e-8■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM14C-203ENST00000467415 899 ntTSL 322.03■■□□□ 1.121e-8■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.961e-8■■■■■ 27.4
DROSHAQ9NRR4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.815e-8■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)31.32■■■□□ 2.65e-8■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 424.42■■□□□ 1.53e-11■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 222.84■■□□□ 1.253e-11■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 420.63■□□□□ 0.893e-11■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 516.97■□□□□ 0.313e-11■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 216.87■□□□□ 0.293e-11■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)27.9■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.486e-8■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.146e-8■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.876e-8■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.246e-8■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.165e-11■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-213ENST00000471154 336 ntTSL 54.42□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 27.3
DROSHAQ9NRR4 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 233.55■■■□□ 2.962e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 DCXR-206ENST00000578273 877 ntTSL 533.17■■■□□ 2.92e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 532.55■■■□□ 2.82e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.792e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 532.46■■■□□ 2.792e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 532.07■■■□□ 2.722e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 DCXR-218ENST00000582900 676 ntTSL 331.15■■■□□ 2.582e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 DCXR-215ENST00000581584 766 ntTSL 330.1■■■□□ 2.412e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.354e-17■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.514e-17■■■■■ 27.2
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