Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN4Q9NRL3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
STRN4Q9NRL3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRN4Q9NRL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRN4Q9NRL3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRN4Q9NRL3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms