Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAPOLBQ9NRJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms