Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAR1AQ9NR31 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms