Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM7Q9NR12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM7Q9NR12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms