Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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