Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms