Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK9Q9NPC2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms