Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDC5

JPH1, Junctophilin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH1Q9HDC5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JPH1Q9HDC5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JPH1Q9HDC5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
JPH1Q9HDC5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH1Q9HDC5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms