Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX8Q9HC52 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms