Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf42Q9H799 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms