Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms