Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD1Q9GZZ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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