Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM39BQ9GZU3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms