Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1EQ9GZS1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms