Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms